A Universidade Mansoura explica que os produtos finais da digestão de proteínas no intestino delgado são os aminoácidos. Os aminoácidos são então absorvidos pela corrente sanguínea através das paredes do intestino com a ajuda de proteínas transportadoras ou outros mecanismos. Esta digestão está no final de um processo de várias etapas durante o qual as proteínas são desnaturadas e progressivamente quebradas em seus peptídeos constituintes por uma sequência de enzimas.
A Universidade Mansoura afirma que o primeiro passo químico para a digestão das proteínas ocorre no estômago. O estômago é o primeiro órgão a armazenar alimentos sólidos, sobre os quais libera o suco gástrico, uma mistura de ácido clorídrico e enzimas. O ácido inicia o processo de desnaturação, que é a quebra do dobramento secundário e terciário das proteínas. Também ativa a pepsina, uma importante enzima que ataca as proteínas. Especificamente, a pepsina quebra a ligação peptídica em aminoácidos aromáticos. Quando as proteínas deixam o estômago, elas são quebradas em grandes polipeptídeos e outros compostos, como proteoses e peptonas.
Uma vez no intestino delgado, os sucos pancreáticos e intestinais são liberados e contêm mais enzimas. A Universidade Mansoura explica que cada enzima do suco pancreático atua em uma categoria diferente de aminoácido, e cada enzima do suco intestinal atua em polipeptídeos de comprimentos diferentes.
