A fórmula estrutural para 3-hexeno é CH3-CH2-CH = CH-CH2-CH3. Um 3-hexeno é um dos muitos isômeros constitucionais de C6H12 e tem um peso molecular de 84,16 gramas por mol.
Um 3-hexeno é uma cadeia de seis carbonos que contém uma ligação dupla entre o terceiro e o quarto carbonos. A ligação dupla pode ser uma ligação dupla cis ou uma ligação dupla trans. Se ambos os carbonos anexados estiverem no mesmo lado da ligação dupla, é uma ligação dupla cis e pode ser escrita como (3Z) -3-hexeno. Se os carbonos anexados estiverem em lados opostos da ligação dupla, é uma ligação dupla trans e pode ser escrita como (3E) -3-hexeno.