A principal diferença é que o amido é convertido pelas plantas, enquanto o glicogênio é convertido pelos animais. No entanto, tanto o amido quanto o glicogênio são polímeros polissacarídeos da alfa-glicose.
O amido pode estar na forma de amilose, com centenas de anéis de glicose unidos por ligações a-1,4, ou amilopectina, que pode conter milhares de anéis de glicose unidos por uma combinação de a-1,4 e a -1,6 ligações.
Glicogênio é o meio pelo qual os animais armazenam glicose para uso posterior. Ele tem ligações a-1,4 e a-1,6, como a amilopectina, permitindo muitos ramos moleculares e, consequentemente, uma área de superfície maior para uma conversão mais rápida por hidrólise de volta em glicose.