Exemplos de arqueobactérias incluem os halófilos, os metanógenos e os termófilos. Arcahebacteria são organismos unicelulares pertencentes ao domínio Archaea. Uma característica que todos eles têm em comum é a capacidade de prosperar em condições ambientais extremas que existiam há vários bilhões de anos.
Os halófilos são encontrados em condições onde o teor de sal é alto. Isso inclui lagos e água do mar. Os metanógenos produzem metano e são encontrados nos intestinos de ruminantes e em pântanos e estações de tratamento de esgoto. Os termófilos são encontrados em ambientes com intenso calor, como em nascentes e perto de fontes hidrotermais. As arqueobactérias são semelhantes às eubactérias por não possuírem núcleo.