Os efeitos colaterais do Muscle Milk incluem ganho de peso, inchaço, gases, diarreia e prisão de ventre, e altas doses podem levar à toxicidade de vitaminas e metais pesados. Muscle Cultivation explica isso, uma vez que cada porção contém cerca de 310 calorias , o ganho de peso com a ingestão excessiva ocorre se essas calorias adicionais não forem compensadas. Muscle Milk também contém frutose cristalina, um adoçante que pode causar inchaço e gases e diarréia ou prisão de ventre, dependendo da pessoa.
Muscle Milk tem altos níveis de metais pesados cádmio, arsênio, mercúrio e chumbo e, de acordo com a Consumer Reports, os níveis são alguns dos mais altos de qualquer proteína em pó no mercado. A Agência para Substâncias Tóxicas e Registro de Doenças lista arsênico, chumbo e mercúrio como as três substâncias de lixo tóxico mais perigosas. A toxicidade do metal pode causar falência de órgãos e danos cerebrais. O corpo leva até 20 anos para eliminar o cádmio, que também causa danos aos rins.
A Revista Vitamin explica que Muscle Milk também contém vitaminas adicionadas, portanto, consumir mais do que a quantidade recomendada pode causar toxicidade das vitaminas. As vitaminas A e D são particularmente preocupantes porque são lipossolúveis, o que significa que o corpo não as elimina ou absorve quantidades excessivas delas. Toxicidade desse tipo leva a dores de cabeça, náuseas e vômitos.