Alguns dos microorganismos mais prejudiciais à humanidade são Staphylococcus aureus, Escheria coli, Enterococcus faecium e Pseudomonas aeruginosa. Microorganismos que causam doenças são chamados de patógenos.
Todas as bactérias, a maioria dos protozoários e alguns fungos são microrganismos. O termo "microorganismos" é usado para indicar uma forma de vida que não é visível ao olho humano sem o auxílio de um microscópio. Eles podem ser uma única célula ou compostos de várias células. Existem microrganismos em todos os tipos de ambiente na Terra, mas existem mais microrganismos benéficos do que nocivos. A engenharia genética envolve a manipulação de microrganismos para criar características específicas em organismos maiores.