Embora nem todo microrganismo seja perigoso, alguns microrganismos podem causar doenças e infecções em humanos e outros seres vivos. Os microrganismos, também chamados de micróbios, também contribuem para a decomposição e deterioração dos alimentos e podem sair resíduos tóxicos para trás, mesmo que sejam erradicados do material contaminado.
Em alguns casos, os microrganismos podem ter efeitos benéficos em pequenas populações, mas um crescimento excessivo pode causar problemas. Por exemplo, a bactéria que vive dentro do trato digestivo humano, quando equilibrada por outros micróbios no corpo, serve a um propósito importante no processo digestivo. No entanto, um desequilíbrio de nutrientes ou um sistema imunológico enfraquecido pode permitir o crescimento de populações de bactérias, levando a uma infecção intestinal e potencialmente a uma doença perigosa.
