Alguns exemplos de bactérias aeróbias incluem Mycobacterium tuberculosis, que causa tuberculose, bactérias do gênero Nocardia, que causam nocardiose, e Psuedomonas aeruginosa, que causa pneumonia, infecções do trato urinário e problemas gastrointestinais. Totalmente aeróbio bactérias têm metabolismos baseados em oxigênio e não podem sobreviver sem oxigênio.
Bactérias anaeróbias não requerem oxigênio. As diferenças entre as bactérias anaeróbias e aeróbias podem ser vistas quando elas são colocadas em um meio de cultura. As bactérias aeróbias se acumulam na superfície do meio líquido para serem expostas à quantidade máxima de oxigênio. Algumas bactérias podem usar, mas não precisam, de oxigênio; outros tipos não conseguem sobreviver na presença de oxigênio livre.