Microscópios são ferramentas fáceis de usar, muitas vezes baratas, disponíveis para quase todas as instalações de saúde do mundo, tornando-os fáceis de obter, mesmo em países do terceiro mundo, mas nem todos têm as habilidades necessárias para usá-los, portanto, diagnósticos errados é uma desvantagem. Os microscópios podem ser usados para ajudar a diagnosticar várias condições e doenças diferentes.
Existem vários tipos de microscópios disponíveis para uso em muitos campos da ciência. Microscópios eletrônicos, de luz e de dissecação são apenas alguns dos muitos disponíveis, e uma desvantagem de ter tantos tipos para escolher é que uma pessoa ou organização pode usar o errado para suas necessidades. Alguns microscópios oferecem resoluções mais altas do que outros e alguns, como microscópios estereoscópicos, permitem que os usuários vejam objetos mais grossos do que muitos outros.
Os microscópios abriram a porta para tantas novas descobertas e tratamentos que as vantagens superam as desvantagens.
