A grande maioria das células procariotas tem paredes celulares. Nas bactérias, elas são feitas de peptidoglicano, enquanto as arqueas usam outros materiais para construir suas paredes celulares, como proteínas ou pseudomureína. O único grupo de procariotos que carece naturalmente de paredes celulares é conhecido como bactéria micoplasma.
A parede celular impede que a água entre na célula bacteriana, inflando-a e causando o estouro de sua membrana celular. É assim que muitos antibióticos atacam as bactérias. Os antibióticos introduzem produtos químicos que interferem na formação das paredes celulares do peptidoglicano. As bactérias precisam formar novas paredes celulares quando se reproduzem por fissão binária.