Uma analogia para o retículo endoplasmático liso são os corredores de uma fábrica pela qual as informações passam. A informação no caso de uma célula é o RNA mensageiro.
Uma célula é análoga a uma fábrica. As matérias-primas vão para a célula ou fábrica para produzir mercadorias, e as mercadorias dependem do tipo de célula. Por exemplo, uma célula do pâncreas produz insulina, um item específico que tem um uso especializado. Para produzir insulina, esta fábrica obtém as matérias-primas de oxigênio e nutrientes.
As partes de uma fábrica têm seus equivalentes nas células. As membranas celulares são como paredes, separando cada parte da fábrica ou célula. O núcleo da célula é a sede ou escritório central, onde estão situados os controles. O DNA, ou planos e manuais de fábrica mantidos com segurança na matriz, são as regras que regem a forma como os produtos serão produzidos. Esses planos são copiados e distribuídos aos trabalhadores como mRNA.
Enquanto o retículo endoplasmático liso são os corredores pelos quais o RNA mensageiro viaja para mover informações, o retículo endoplasmático rugoso é a linha de montagem onde as operárias ou ribossomos montam os produtos, que são as proteínas. As matérias-primas são mantidas na sala de estoque, ou citoplasma, retirado pelo tRNA, ou ajudantes de estoque, quando são necessárias na linha de montagem.