Talvez a analogia mais clara que pode ser feita para descrever o papel do retículo endoplasmático rugoso seja a de uma linha de montagem de fábrica. Ao longo de sua superfície, que Dictionary.com descreve como "áspera" devido a os ribossomos dispostos ao longo de sua membrana, as proteínas são sintetizadas e transportadas para uso na química celular.
O retículo endoplasmático rugoso é uma estrutura longa e convoluta dentro da célula que é dobrada em uma série de bolsas ao longo de seu curso. Ele conecta o núcleo da célula com sua membrana plasmática e freqüentemente está entrelaçado com o retículo endoplasmático liso, que tem uma função sutilmente diferente e é dobrado em uma forma mais tubular do que o retículo endoplasmático rugoso. Proteínas e, em leucócitos, anticorpos são montados ao longo do retículo endoplasmático rugoso e transportados para qualquer uma das extremidades para uso na biologia celular, de acordo com About.com.
A partir da descrição que About.com dá, é fácil imaginar os componentes de várias proteínas, como a insulina, sendo transportados ao longo de sua superfície e montados como se fossem carros em uma fábrica. Quando as proteínas chegam ao fim de sua jornada, elas estão prontas para uso na manutenção do equilíbrio químico do corpo e são liberadas no citoplasma.
