O gel de agarose é usado no processo de eletroforese, que separa fragmentos de DNA de acordo com sua estrutura e dimensões moléculas de DNA são geralmente digeridas com enzimas de restrição, e a eletroforese em gel de agarose serve como uma ferramenta de diagnóstico para ajudam os pesquisadores a visualizar fragmentos. O gel de agarose é uma substância espessa e viscosa, composta por matrizes polissacarídicas, que essencialmente captura moléculas transportadas por correntes elétricas.
A técnica de eletroforese em gel de agarose tem várias aplicações importantes. Este método é usado em ciência forense, bem como em laboratórios químicos e nas áreas farmacêutica e médica. De acordo com a ASU, o gel de agarose permite que as pessoas analisem fragmentos de DNA que ocorrem como resultado da digestão enzimática de pedaços maiores de DNA. O gel permite a visualização clara dos fragmentos, o que é essencial para determinar o tamanho das partículas em muitos campos de pesquisa. À medida que as moléculas de DNA são colocadas em campos com correntes elétricas, as moléculas com carga negativa migram em direção à extremidade positiva do campo, que contém gel de agarose com carga positiva. O gel é uma rede de matriz reticulada que serve como uma malha ou tela tridimensional para atrair moléculas de DNA carregadas negativamente. Essas moléculas são puxadas para a extremidade positiva da base do gel por correntes, mas encontram resistência da agarose, que isola as moléculas de DNA.