Um anaeróbio aerotolerante é um organismo que tolera a presença de oxigênio, mas não o exige para o crescimento . Em vez disso, os anaeróbios aerotolerantes usam a fermentação para sobreviver. Um exemplo de organismo é o lactobacillus, uma bactéria que vive no intestino dos humanos e também é usada na produção de iogurte.
O processo de fermentação envolve a conversão do açúcar em ácidos, açúcar e /ou etanol, como forma de formação de energia. Existem muitas vias de fermentação utilizadas, mais comumente por meio do ácido lático. Os fungos, como as leveduras, tendem a usar a fermentação com etanol. Este processo libera menos energia do que os métodos aeróbicos, pois depende da regeneração do ATP do ADP.