A geometria molecular do PF5, pentafluoreto de fósforo, é bipiramidal triangular. Ele tem 10 elétrons em torno de um átomo de fósforo central, criando cinco pares de elétrons em uma forma trigonal bipiramidal.
De acordo com o Chem Tube 3D e o departamento de química da Purdue, o PF5 tem três átomos de flúor que se encontram ao longo do equador da molécula. Ele também possui dois átomos de flúor que são axiais e se situam em um plano perpendicular ao plano equatorial. Os átomos de fósforo e flúor estão ligados covalentemente. Os ângulos de ligação entre as três posições equatoriais são de 120 graus cada, e os ângulos de ligação entre as posições axial e equatorial são de 90 graus cada. De acordo com a página Tutor Homework de David Roth, PF5 tem um modelo de hibridização de sp3d, e tem uma distribuição de carga simétrica; portanto, a molécula é apolar.