O iodo purifica a água oxidando as membranas e organelas de patógenos nascidos na água, perturbando suas funções biológicas e fazendo com que morram. O tratamento com iodo é uma maneira rápida e econômica de neutralizar patógenos em água doce para beber.
O iodo é altamente eletronegativo, o que o torna um agente oxidante excepcional. As membranas e organelas das bactérias são suspeitas de oxidação. Quando o iodo reage com essas estruturas vivas, os compostos que compõem essas estruturas são oxidados, enquanto os átomos de iodo são reduzidos a íons iodeto negativos, perturbando o equilíbrio iônico dos patógenos, levando à sua morte.
O iodo mata muitos patógenos em fontes naturais de água doce. É uma maneira imperfeita, mas leve e eficaz de purificar a água potável no campo. As lojas de camping possuem kits de purificação de iodo que consistem em uma pílula de iodo e um neutralizador de sabor para remover o sabor desagradável que a purificação de iodo produz. Os neutralizadores do sabor precipitam o iodo e devem ser adicionados após dar ao iodo tempo suficiente para neutralizar os patógenos nascidos na água. Esses neutralizadores incluem ácido ascórbico e carbono ativo.
O iodo é sensível à luz e deve sempre ser armazenado em um frasco escuro para evitar que se estrague. A dose máxima recomendada de iodo na dieta é de 2 miligramas por dia, enquanto a duração máxima recomendada de uso é de três semanas, de acordo com a Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA. Pessoas que têm problemas de tireoide, tomam lítio ou estão grávidas devem consultar um médico antes de usar a purificação de água à base de iodo.