As proteínas desnaturadas são hidrolisadas e as ligações peptídicas são quebradas em aminoácidos de fácil digestão. Os suplementos protéicos geralmente contêm proteínas desnaturadas para aumentar a absorção. Os atletas usam proteínas desnaturadas para obter proteína suplementar em seus músculos mais rapidamente.
O processo de desnaturação não é forte o suficiente para quebrar as ligações peptídicas que compõem os aminoácidos na proteína, então eles permanecem úteis para suplementos e bebidas nutricionais. O calor é o principal método para desnaturar a proteína. A energia cinética do aumento da temperatura faz com que as moléculas da proteína vibrem e as ligações se quebrem. Algumas das vitaminas e minerais são perdidos durante o processo, mas os aminoácidos geralmente permanecem intactos. Proteínas desnaturadas em pós geralmente incluem suplementos adicionados para compensar os nutrientes perdidos.
A maioria das proteínas é desnaturada quando as pessoas as comem. Cozinhar clara de ovo desnatura a proteína. A desnaturação reorganiza as proteínas, mas não as destrói. Algumas proteínas desnaturadas por alto calor têm valor nutricional inferior. A desnaturação da proteína requer ajustes precisos de temperatura e, muitas vezes, um processo que renatura a proteína antes do uso em pós e suplementos. Os suplementos de proteína não desnaturada renunciam ao processo de desnaturação e têm mais dos nutrientes originais. Os suplementos de proteína são principalmente desnaturados para aumentar a absorção e reduzir os contaminantes.