Homens que tomam estrogênio regularmente notam que sua pele fica mais macia e a quantidade de pelos no corpo diminui. Os seios aumentam ligeiramente e os testículos diminuem de tamanho. O tamanho da cintura diminui e os quadris, coxas e nádegas ficam maiores, de acordo com Michele O'Mara, Ph.D.
O estrogênio faz com que os quadris, coxas e nádegas ganhem depósitos de gordura, e a tendência de a gordura se acumular ao redor do estômago diminui. Junto com o tamanho dos testículos e do pênis, a próstata diminui de tamanho ao tomar estrogênio e um medicamento chamado finasterida. A produção de testosterona e esperma também é bastante reduzida, relata Michele O'Mara, Ph.D.O uso prolongado de estrogênio e medicamentos semelhantes pode causar infertilidade que é permanente em alguns casos. A capacidade de atingir e manter uma ereção costuma ser bastante reduzida. A voz não é alterada pela ingestão de medicamentos hormonais.
A ejaculação torna-se menor; às vezes é apenas uma pequena e clara quantidade de secreção devido ao encolhimento da próstata. Isso não significa que não haja orgasmo. Muitas mulheres transexuais relatam uma melhora na sensação de orgasmo.
O tamanho do tecido mamário varia como nas fêmeas genéticas. É raro ver algo maior do que o tamanho do copo B após dois anos.