O apodrecimento da madeira é uma alteração química. Uma alteração ou reação química ocorre quando a substância foi alterada quimicamente e apresenta diferenças nas propriedades químicas e físicas.
As alterações químicas incluem queimar, apodrecer, cozinhar ou enferrujar. Após a ocorrência de uma alteração química, a substância apresenta uma nova remodelação química. Existem muitos sinais de uma mudança ou reação química, como a formação de bolhas de gás, o aparecimento de turvação, uma mudança na cor ou a liberação de um odor. Embora os sinais sejam precisos, a única maneira de saber completamente se uma alteração é química ou física é realizar análises químicas na substância.