Eubactérias, também conhecidas simplesmente como "bactérias", podem ser encontradas em todos os habitats da Terra. Esses organismos são amplamente variados e muito adaptáveis, causando muitas doenças em humanos, mas também realizando muitos processos úteis.
Uma maneira pela qual as eubactérias podem ser identificadas é pelo uso de oxigênio. Aqueles que usam oxigênio ou prosperam em ambientes ricos em oxigênio são chamados de aeróbios, enquanto aqueles que não usam são chamados de anaeróbios. Algumas eubactérias são capazes de criar endosporos, que lhes permitem sobreviver em condições muito adversas. Por causa disso, as eubactérias podem ser encontradas até mesmo em ambientes congelados, quentes, radioativos ou quimicamente hostis.