A eutrofização de um ecossistema aquático pode ser retardada ou revertida diminuindo a adição de nutrientes ao sistema. Fontes de nutrientes em excesso podem ser fisicamente impedidas de entrar no ecossistema afetado. Como alternativa, essas fontes podem ser tratadas para remover nutrientes em um ponto a montante do ecossistema afetado.
Corpos de água tornam-se eutróficos devido a um aumento nos nutrientes disponíveis, mais comumente fósforo e nitrogênio. Alguns fluxos de resíduos ricos em nutrientes entram em lagos e rios acidentalmente; outros são deliberadamente descartados como forma de descartar materiais indesejados. Fontes comuns de nutrientes são estrume agrícola e escoamento de fertilizantes e efluentes de águas residuais municipais.
Práticas agrícolas, como cultivo reduzido, aplicação reduzida de fertilizantes e cultivo de cobertura, ajudam a minimizar a quantidade de escoamento de fertilizante que ocorre. Cercas e zonas de amortecimento vegetativo impedem ainda mais o solo e o fertilizante solúvel em água de deixar os campos agrícolas e entrar em lagos e riachos. As fontes de estrume agrícola contidas, tratadas e geridas de forma adequada e que não fluem diretamente para lagos e rios ajudam ainda mais a prevenir a eutrofização. Também é importante que o gado e outros animais sejam impedidos de pastar perto ou atravessar riachos e rios. O proprietário de uma casa pode reduzir a quantidade de fertilizante de gramado que usa e usar produtos para cuidar do gramado com baixo teor de fosfato.
