Os peixes se protegem por meio de camuflagem colorida, espinhos venenosos, choques atordoantes e produtos químicos. O veneno injetado pelos dentes, ou por meio de farpas ou espinhos é uma defesa útil empregada por bagres e peixes-escorpião.
Algumas espécies, como peixinhos, avisam outras pessoas de seu grupo quando liberam uma substância química na água. Uma solha do Mar Vermelho chamada sola de Moisés libera uma substância química tão eficaz que até os tubarões os evitam. Frequentemente alvo de predadores, os olhos de um peixe são camuflados com uma mancha preta perto da parte traseira do corpo. Os predadores visam aquele local em vez da cabeça, o que permite tempo suficiente para a fuga.