O sistema digestivo mantém a homeostase criando o equilíbrio adequado do pH no ambiente gástrico. Além disso, ao manter a proporção correta de enzimas, o sistema digestivo nutre bactérias benéficas que inibem doenças e produzem substâncias biológicas que necessidades do corpo, como vitamina K.
A homeostase é o equilíbrio que o corpo mantém para continuar a funcionar corretamente. Todos os sistemas corporais, incluindo o sistema digestivo, contribuem para a homeostase. O corpo mantém a homeostase usando mecanismos positivos e negativos. O feedback negativo ocorre quando o corpo sente um desequilíbrio e os vários sistemas trabalham para contrabalançar e restaurar o equilíbrio adequado. O feedback positivo acontece quando o corpo percebe uma mudança e trabalha para melhorá-la.
O equilíbrio do pH do corpo, sua proporção de ácido e alcalino, é uma parte importante da homeostase geral. Na boca, a saliva é apenas ligeiramente ácida. No entanto, o sistema digestivo precisa e mantém um ambiente altamente ácido para decompor os alimentos rapidamente. Junto com a regulação do equilíbrio do pH, o sistema digestivo mantém a microflora, como acidophilus e bifidobacterium, que quebram os carcinógenos causadores de câncer e outras infecções. Depois de quebrar os alimentos por meio de um sistema complexo semelhante a um transportador, o sistema digestivo passa os nutrientes necessários para o sistema circulatório para serem absorvidos pelo corpo.