O calcário pode ser formado por evaporação, como é o caso das estalactites e estalagmites em cavernas, ou pelo acúmulo de carbonato de cálcio em ambientes marinhos. O calcário é uma rocha sedimentar biológica ou química, dependendo do seu método de formação.
As formações calcárias criadas por evaporação são rochas sedimentares químicas, também conhecidas como travertino. Eles são formados quando gotículas contendo carbonato de cálcio vazam pelo teto das cavernas e evaporam. À medida que cada gota evaporada deixa para trás uma pequena quantidade de carbonato de cálcio, forma-se uma estalactite. Se as gotículas caírem no chão e depois evaporarem, uma estalagmite se estende para cima à medida que o carbonato de cálcio começa a se acumular. Muitas cavernas são preenchidas com esses dentes de calcário característicos.
O calcário sedimentar biológico forma-se mais frequentemente em águas marinhas rasas e quentes em áreas entre 30 graus de latitude norte e 30 graus de latitude sul. Este tipo de calcário é formado à medida que organismos marinhos com conchas e esqueletos de carbonato de cálcio morrem e se acumulam camada por camada. Eventualmente, com extensa pressão e tempo, esse sedimento de carbonato de cálcio endurece em calcário. Esses tipos de rochas costumam conter fósseis. Um método menos comum de formação de calcário é por meio do acréscimo direto de carbonato de cálcio de água salgada ou doce.