As colônias reais eram governadas pela monarquia inglesa por meio de um governador real nomeado pela monarquia e também por um conselho real. O governador e o conselho eram assistidos por conselhos inferiores que supervisionavam.
Muitas colônias reais não começaram sendo governadas dessa forma. Em vez disso, muitas vezes eram proprietários ou joint ventures com alvarás da monarquia inglesa. No entanto, quando essas cartas atingiram seu limite de tempo ou foram revogadas pela monarquia, as colônias se converteram em colônias reais. Os colonos estavam preocupados com a instabilidade de como eram governados, pois os governadores proprietários podiam mudar ou mesmo ser depostos pelos colonos antes que a conversão em colônias reais trouxesse ainda mais mudanças.
O governador de uma colônia real era nomeado pelo rei e executava os desejos do rei e não os desejos do próprio governador. As instruções reais assumiam duas formas: uma comissão geral, que, sendo lida em voz alta quando o governador foi nomeado, era basicamente de conhecimento público e instruções especiais que normalmente eram lidas apenas pelo próprio governador.
Dentro das colônias, o governador era a mais alta autoridade judicial, incentivado pela monarquia a usar seus poderes de veto para promover os interesses britânicos sempre que possível. O governador, seu conselho real e outros membros oficiais do governo da colônia real eram normalmente selecionados devido às suas conexões sociais e políticas, em vez de experiência ou capacidade de governar os outros.