A alta biodiversidade melhora um ecossistema, tornando-o menos suscetível a desastres e aumentando as taxas de reprodução das plantas. Todas as espécies em um ecossistema dependem umas das outras de alguma forma, e com menos biodiversidade, o ecossistema é mais vulnerável ao colapso.
Como um exemplo da importância da alta biodiversidade, uma doença uma vez destruiu a maioria dos castanheiros do leste da América do Norte, mas os ecossistemas se recuperaram porque outras árvores não foram afetadas pela doença. Em uma área com menos biodiversidade, tal doença poderia ter resultado na perda massiva de habitat, levando ao potencial deslocamento e extinção de espécies.
A alta diversidade genética, que é outro tipo de biodiversidade, afeta os ecossistemas ao melhorar a saúde dos descendentes. As espécies que não são geneticamente diversas são mais propensas à extinção como resultado da suscetibilidade a doenças e defeitos congênitos. Uma espécie é mais saudável quando várias populações estão prosperando.
A extinção como resultado da falta de biodiversidade pode ter um impacto negativo significativo em um ecossistema, especialmente se esse ecossistema já tiver baixa biodiversidade. Se não houver nenhuma outra espécie naquele ecossistema que possa cumprir o papel das espécies que foram extintas, todo o ecossistema estará em risco de colapso. Como as espécies em um ecossistema dependem umas das outras, uma extinção pode facilmente levar a outra.