O primeiro experimento científico que indicou a existência de átomos foi realizado por John Dalton durante os anos 1800. Esses primeiros experimentos não forneceram informações sobre a estrutura do átomo. A estrutura dos átomos foi explicada pela primeira vez através da descoberta dos elétrons em 1897 pelo físico J. J. Thompson.
A ideia filosófica de um átomo foi desenvolvida pelo filósofo grego Demócrito em 460 a.C. A ideia de um átomo foi o resultado de uma questão relativa aos limites da divisão da matéria. Esta ideia foi posteriormente rejeitada por Aristóteles e, portanto, não recebeu nenhum mérito de filósofos gregos ou indivíduos.