Os fungos são heterótrofos, o que significa que satisfazem suas necessidades de carbono e energia quebrando e assimilando matéria orgânica. Os fungos são capazes de absorver e metabolizar uma ampla variedade de carboidratos, incluindo glicose, xilose e frutose. Os carboidratos mais difíceis também são facilmente digeridos, como a celulose e a hemicelulose.
Os fungos usam enzimas para quebrar os materiais nos quais estão crescendo. Ao absorver o material digerido, o alimento deve estar na forma de solução para entrar nas paredes das hifas dos fungos. Os fungos e bactérias sapróbicos são os grandes responsáveis pela maior parte da decomposição orgânica. Em geral, os fungos precisam de oxigênio para sobreviver, mas também podem usar a fermentação quando não têm oxigênio.