Os fungos saprotróficos absorvem nutrientes da matéria orgânica em decomposição. Eles liberam ácidos e enzimas que quebram o tecido morto em partículas menores para que possam ser absorvidos. Esses cogumelos são extremamente importantes para a cadeia alimentar porque ajudam a reciclar a matéria morta de volta para o solo.
O comportamento saprotrófico é uma das quatro maneiras pelas quais os fungos obtêm nutrientes. Os cogumelos miorrízicos formam relações simbióticas com outras plantas e animais. Normalmente, a relação é mutualística, o que significa que ambos os organismos se beneficiam. O cogumelo tece em torno das células da raiz da planta ou envolve as próprias raízes. O cogumelo fornece umidade e nutrientes adicionais para a planta e, por sua vez, ele ganha acesso aos açúcares que a planta produz. Os fungos endofíticos também formam uma relação mutualística com uma planta hospedeira. No entanto, eles têm sua própria categoria porque, ao contrário dos cogumelos miorrízicos, podem ser facilmente cultivados em um laboratório sem a presença de uma planta hospedeira. Os cogumelos parasitas infectam e se alimentam de organismos vivos, acabando por matá-los.
