O retículo endoplasmático rugoso (ER) desempenha várias funções cruciais, como a fabricação de enzimas lisossomais, a fabricação de proteínas secretadas, a integração de proteínas na membrana celular e a facilitação da glicosilação. O ER rugoso é um componente auxiliar de o retículo endoplasmático mais amplo, que contém uma superfície lisa além das bordas ásperas do ER. Apesar de compartilhar um local, o ER suave e áspero desempenha funções diferentes para facilitar as operações básicas dentro das células.
A diferença entre o ER rugoso e o ER liso começa no nível da superfície. A superfície do RE áspero é pontilhada com ribossomos produtores de proteínas, o que lhe confere uma aparência pontilhada e irregular. De acordo com a Georgia State University, o ER rugoso é identificado pela presença de ribossomos porque o ER liso não atrai ou retém esses componentes celulares. O ER bruto contém um sítio de ligação chave, chamado translocon, que atrai e captura ribossomos. Os ribossomos apenas se ligam à superfície ER por breves períodos de tempo; no entanto, eles permanecem o tempo suficiente para completar a formação de uma proteína-ácido nucléico. Além de servir como local para abrigar os ribossomos, os REs ásperos produzem várias enzimas e proteínas, que são então secretadas para a célula circundante. ERs ásperos também geram bolsas protetoras, que transportam proteínas para o complexo de Golgi.