Fatores bióticos de rios incluem insetos, peixes, perifíton e macroinvertebrados bentônicos categorizados em grupos de alimentação funcional, como trituradores e pastadores. Esses organismos vivos constituem alguns dos fatores bióticos mais importantes em qualquer ecossistema de rio , de acordo com a Nature Education.
O ecossistema do rio fornece um ambiente dinâmico para a diversidade biótica. Ecologistas aquáticos tendem a se concentrar em macroinvertebrados bentônicos em seus estudos sobre ecossistemas fluviais devido à sua abundância e complexidade. Os quatro grupos de alimentação funcional de macroinvertebrados bentônicos incluem trituradores, que cada um sai; coletores, que consomem matéria orgânica finamente particulada; pastadores, que se alimentam de perifíton; e predadores. O próprio habitat físico do rio determina qual dessas quatro categorias de organismos é mais pronunciada. Pequenos riachos temperados, por exemplo, fornecem as condições ideais para trituradores e coletores prosperarem, enquanto dosséis que se abrem em riachos maiores dão aos pastores melhor acesso à sua principal fonte de alimento, o perifíton.
Os peixes também são importantes contribuintes para o ecossistema do rio, especialmente os peixes anádromos que passam a maior parte de suas vidas em um ambiente marinho e viajam rio acima para se reproduzir. Esses peixes trazem nutrientes marinhos para o meio ambiente, o que pelo menos um experimento associou a um aumento da abundância de insetos no ecossistema do rio, conforme afirma a Nature Education.