Enquanto a reciclagem mantém muitos itens descartados fora dos aterros e preserva os recursos naturais, ela também tem algumas desvantagens, como o gasto e a poluição decorrentes da operação de equipamentos de reciclagem, a produção de gás metano e a falsa noção de que usar itens recicláveis com desperdício é aceitável.
O processo de reciclagem de muitos produtos diferentes leva ao desenvolvimento de gás metano. Embora muitas usinas de reciclagem contenham metano, quando ele vaza, o metano pode esgotar a camada de ozônio e contribuir para o aquecimento global, pois é um gás de efeito estufa. Manter e operar equipamentos de reciclagem é extremamente caro, e ter uma rede inteira de fábricas processando a reciclagem leva a uma poluição adicional.
Quando as instalações de reciclagem têm uma gestão deficiente, a higiene da área pode ser prejudicada. Lixeiras de reciclagem que foram abandonadas às vezes têm toxinas remanescentes de materiais recicláveis, e as toxinas têm o potencial de entrar na água subterrânea ou no ar como poluente.
Muitas pessoas acreditam que, como a reciclagem está disponível, o uso de garrafas plásticas de água às dúzias é aceitável. Embora seja possível reciclar o plástico, é ainda melhor para o meio ambiente ter uma garrafa reutilizável, pois assim a poluição que vai para a reciclagem não se torna uma necessidade.