As partes do cogumelo são a tampa, brânquias ou poros, esporos, caule, anel, volva, micélio e hifa. O cogumelo pode ser dividido em seções subterrâneas e acima do solo.
A tampa do cogumelo é a parte superior. Pode ser cônico, plano ou esférico e apresentar texturas variadas dependendo do tipo de cogumelo e do estágio de desenvolvimento. Sua função é proteger as brânquias, localizadas na parte inferior da tampa e compostas por finas camadas semelhantes a papel empilhadas lado a lado. Alguns cogumelos têm poros em vez de guelras. São tubos minúsculos compactados que se assemelham a uma esponja. As guelras e os poros produzem esporos, o elemento reprodutor do cogumelo.
A haste do cogumelo suporta a tampa e pode não estar presente em alguns tipos. O anel do cogumelo é encontrado na parte superior do caule e é um remanescente de uma cobertura protetora para as guelras que se rompia com o crescimento da capa. Na base do caule há uma cobertura remanescente semelhante que outrora protegia o cogumelo inteiro. A porção subterrânea do cogumelo é o micélio. Na parte inferior, há hifas, que são filamentos brancos semelhantes a raízes que coletam água e matéria orgânica para o cogumelo.
