A linha 2 com destino ao Bronx atende a entrada do Bronx River do zoológico, também identificada como portão B. Os passageiros devem descer na estação Pelham Parkway e seguir para oeste até a entrada. O trem expresso da Seventh Avenue (a linha 2) atende todas as estações mais transitadas de Manhattan, incluindo 42nd e Times Square.
Os passageiros devem sempre verificar com a Autoridade de Transporte Metropolitano se há interrupções de serviço e horários de operação. O zoológico do Bronx também é acessível de ônibus. O expresso BxM11 para ao longo da Madison Avenue em Manhattan e segue diretamente para o portão B. Do Queens, os ônibus Bx9 e Bx19 param na entrada de pedestres do zoológico na 183rd Street e Southern Boulevard.