Algumas das desvantagens das viagens espaciais incluem a NASA gastar dinheiro em projetos quando não está ciente de quanto investimento comercial pode contar, há riscos para a segurança humana em cada missão e certas órbitas são muito lentas. Além disso, as mudanças no financiamento de viagens espaciais podem dificultar que os alunos se tornem astronautas.
Embora a NASA agora faça parceria com empresas privadas para financiamento de viagens espaciais, não há garantia de que as empresas privadas possam investir. Embora muitos mostrem interesse, isso pode significar que a NASA começa a trabalhar em projetos que ficam sem financiamento comercial. Se apenas um pequeno número de empresas privadas mostrar um investimento, o estabelecimento de contratos torna-se ineficiente. Além disso, as viagens espaciais não são seguras, com tragédias históricas, incluindo a perda de Challenger em 1986 e Columbia em 2003. Outras perdas podem ser prejudiciais em termos de vidas humanas e reputação das viagens espaciais, levando a regulamentações restritivas.
Logisticamente, alguns aspectos da viagem espacial são desafiadores. Como as naves só podem transportar quantidades limitadas de combustível, elas dependem de órbitas planetárias e impulsos gravitacionais para completar as missões. Essas transferências também limitam o número de lançamentos que um navio pode fazer. Por exemplo, a transferência Terra-Marte está disponível apenas uma vez a cada 2 anos, e a transferência Terra-Júpiter está disponível uma vez a cada 13 meses. Ambos são lentos.
Com o governo federal transferindo o financiamento do programa espacial para fontes privadas, há menos oportunidades para os alunos se tornarem astronautas. Normalmente, eles entram no programa depois de uma carreira na Força Aérea, mas menos financiamento federal significa chances reduzidas de isso acontecer.
