As bactérias encontradas na água da torneira incluem cryptosporidium, legionella pneumophila, rotíferos, copépodes e Escherichia coli, mais comumente conhecida como E. coli. Rotíferos e copépodes são comumente encontrados na água potável e podem crescer o suficiente para serem vistos com o olho humano, mas raramente são prejudiciais aos humanos. A E. coli pode existir legalmente em até 5% das amostras de água potável, de acordo com os padrões da Agência de Proteção Ambiental.
Legionella pneumophila, a bactéria que causa a doença dos legionários, existe naturalmente na água, mas é frequentemente erradicada por filtração e técnicas de tratamento de água. Apenas em casos raros a legionela aparece na água potável. Em 2015, ocorreu um surto na cidade de Nova York devido a água contaminada, infectando 127 pessoas e matando 12.
Resíduos fecais humanos e animais são fontes comuns de contaminação por cryptosporidium, um organismo unicelular. Uma pessoa infectada com cryptosporidium pode apresentar sintomas como diarreia, vômitos e cólicas. As técnicas modernas de filtração e tratamento de água filtram aproximadamente 99% dessas bactérias da água potável.
Também é possível encontrar as bactérias anabaena circinalis e salmonella enterica na água da torneira, bem como os esporos de fungos Chaetomium e rhizopus stolonifer, que é mais comumente conhecido como bolor preto do pão.
