Lewis e Clark cruzaram a Cordilheira Bitterroot, um segmento ao norte das Montanhas Rochosas. Embora os picos das Bitterroots tenham em média de 9.000 a mais de 11.000 pés, eles encontraram uma rota para o oeste através das montanhas através Lolo Pass, que está a uma altitude de 5.236 pés.
Um dos objetivos principais da expedição de Lewis e Clark era procurar a Passagem do Noroeste, uma hipotética rota de água do Oceano Atlântico ao Oceano Pacífico. Outros objetivos incluíam fazer contato diplomático com os nativos americanos, estendendo o comércio de peles a novos territórios e explorando o rio Missouri, o noroeste do Pacífico e a recém-comprada Louisiana Purchase. Eles partiram para o rio Missouri em maio de 1804 com 33 outros homens. Em Dakota do Norte, eles construíram o Fort Mandan para esperar o inverno. Em abril de 1805, eles continuaram ao longo do Missouri até chegarem às Montanhas Rochosas, onde tiveram que continuar a cavalo. Do outro lado da divisão continental, eles continuaram de canoa descendo os rios Clearwater e Snake até chegarem ao rio Columbia, que os levou o resto do caminho até o Pacífico.
Lewis e Clark e os homens de sua expedição, chamados de Corpo de Descoberta, chegaram de volta a St. Louis em setembro de 1806 após terem viajado quase 8.000 milhas. Eles foram recebidos como heróis pelo presidente Thomas Jefferson, pelo Congresso e pelo público americano.