A Coreia do Sul abriga uma grande variedade de mamíferos e pássaros nativos. Alguns deles, como a ameaçada marreta-baikal, vivem principalmente no bioma local, enquanto outros, como as baleias, apenas visite as águas perto da Coreia do Sul sazonalmente.
As baleias são alguns dos visitantes mais espetaculares da Coreia do Sul. As espécies de baleias que podem ser encontradas a poucos quilômetros da costa são as baleias jubarte, cachalotes e baleias cinzentas. No interior, a Coreia do Sul tem peixes que vivem em rios e lagos, alguns dos quais não vivem em nenhum outro lugar da Terra. Entre eles estão o Somjiny Bitterling, o Stumpy Bullhead coreano, várias espécies de Loach e o Shiner preto.
A Coreia do Sul tem quatro espécies nativas de salamandra, notavelmente a salamandra de fenda coreana. Esta espécie é incomum por ser a única espécie de salamandra sem lua conhecida por ser endêmica da Ásia. Os adultos respiram diretamente pela pele, não com os pulmões, como a salamandra coreana com garras faz.
O rato do campo listrado é comum no Leste Asiático, mas a Coreia do Sul tem sua própria variante, o rato do campo listrado de Jeju, que alguns naturalistas sugeriram que deveria ser classificado como sua própria espécie. A Coreia do Sul também tem vários invertebrados nativos, incluindo um katydid (Sphagniana monticola), uma mariposa (Pyrausta nigrimaculata) e um besouro de chifre longo (Demonax seoulensis).