As colônias de leveduras são maiores do que as colônias de bactérias porque as células de leveduras individuais são consideravelmente maiores do que as células bacterianas. As leveduras e as bactérias são microrganismos unicelulares, mas as leveduras são eucariotas e as bactérias são procariotas. Uma célula eucariótica contém um núcleo e organelas estruturais encerradas em uma membrana dupla. As leveduras também têm paredes celulares espessas que encapsulam o organismo. Os procariontes, como as bactérias, são menores porque não têm núcleo e organelas ligadas à membrana.
As células de levedura aumentam em número assexuadamente por brotamento. Conforme explicado por Gary Kaiser, do Community College of Baltimore County, um botão se forma na superfície externa de uma célula-mãe e o núcleo da célula se divide. Um dos núcleos divididos entra no botão em formação e o material da parede celular é produzido entre a célula-mãe e o botão. O botão se quebra para se tornar uma nova célula filha. Esta multiplicação de células de levedura geneticamente idênticas povoa uma colônia. As bactérias dividem e povoam as colônias por meio da fissão binária, outra forma de reprodução assexuada. O DNA circular da bactéria se replica e as cópias são separadas em extremidades opostas da célula. A parede celular da bactéria cresce, enquanto forma uma fenda no centro da célula. A fenda acaba comprimindo a célula que se divide em duas células-filhas separadas, mas idênticas. A fissão binária continua dentro de cada célula filha, povoando a colônia bacteriana.