As cianobactérias pertencem ao reino Monera. As cianobactérias, também chamadas de algas verde-azuladas, são organismos que pertencem a um grande e heterogêneo grupo de espécies que são principalmente autotróficas e produzem seus próprios alimentos usando fotossíntese.
As cianobactérias parecem bastante semelhantes às algas eucarióticas e compartilham várias características biológicas importantes, e essas características procarióticas dominantes são o que as torna classificáveis como bactérias no reino Monera.
Tal como acontece com outros procariotas, as cianobactérias não têm núcleos fechados por membranas. Eles não têm aparelhos de Golgi, cloroplastos ou estruturas de retículo endoplasmático. Enquanto os organismos eucarióticos usam essas organelas para realizar suas funções básicas de vida, as cianobactérias e outros procariotos dependem das membranas celulares bacterianas para realizar essas tarefas.
Algumas cianobactérias, nomeadamente plânctons e alguns tipos de algas e algas marinhas, têm câmaras de gás para aumentar os seus níveis de flutuabilidade, que é outra característica comum aos monerans. As cianobactérias possuem outras características fisiológicas, químicas e genéticas que as distinguem como monerans. Esses organismos podem ser unicelulares ou ter células múltiplas e ter estruturas filamentosas. Muitos têm tecidos de invólucro fortes que unem outras células ou seus filamentos em colônias estruturadas.
As cianobactérias, como outras do reino Monera, contêm apenas um tipo de clorofila, que forma um pigmento verde. Diferentes espécies contêm diferentes tipos e quantidades de carotenóides, como pigmentos azuis e vermelhos, que lhes dão cores ligeiramente diferentes.