A perseguição aumentou porque a Igreja Católica estava descontente com as novas ideias trazidas pela Reforma e queria esmagar toda a oposição. Durante a Reforma, a violência foi o principal meio de parar revoluções ou novas mudanças radicais .
A Reforma ocorreu no século 16 e lidou com as várias idéias do Cristianismo. Muitos cristãos ficaram chateados com a Igreja Católica por razões como permitir que o Papa estabeleça todas as regras e seja a autoridade máxima nas práticas cristãs. Esses cristãos desenvolveram seu próprio conjunto de regras e desafiaram as regras católicas.
Um dos líderes da Reforma mais proeminentes foi Martinho Lutero. A contribuição de Lutero para a religião cristã mais tarde se tornaria conhecida como denominação luterana. Houve muitas denominações diferentes que surgiram a partir da Reforma Protestante.
Acredita-se que o próprio Lutero iniciou a Reforma com seu tratado intitulado "95 teses". O documento foi publicado em 1517 e se espalhou rapidamente devido à invenção da imprensa. Na publicação, Lutero afirmou que acreditava que a igreja precisava ser purificada e focar na Bíblia mais uma vez do que na tradição. Não era uma ideia nova, mas não tinha sido ouvida publicamente e ajudava a organizar o povo.
