De acordo com SFGate, a água do lago fica marrom por vários motivos, mas as causas mais comuns são erosão do solo, plantas microscópicas e vida selvagem. Grandes quantidades de plantas microscópicas, como algas e fitoplâncton, dão origem ao lago água com uma aparência quase de chá. A erosão do solo faz com que as margens da lagoa se rompam e caiam na água, dando a ela uma aparência marrom.
SFGate diz que o rápido crescimento de algas, conhecido como florescimento de algas, é causado por grandes quantidades de dejetos animais, nitrogênio e fósforo na água do lago. Quando isso acontece, a água da lagoa começa a ficar verde. No entanto, conforme as algas começam a se decompor, a água começa a ficar marrom. A decomposição de qualquer tipo de material orgânico em uma lagoa causa água marrom. Um exemplo desse material orgânico é a queda de folhas de árvores próximas.
Existem várias maneiras de evitar a água marrom do lago. Por exemplo, o plantio de vegetação ao redor das margens do tanque cria uma zona tampão. Isso elimina o tráfego de pedestres próximo à borda da lagoa, evitando a erosão do solo. Também é possível manter a população de peixes em uma lagoa, estocando-a com peixes predadores, como o tucunaré.