Pitágoras foi educado em Tiro, Samos e Mileto, que atualmente são a Síria e a Ásia Menor, bem como o Egito. Ele mais tarde fundou sua própria escola de mistérios em Crotona, que fica no sul da Itália.
Quando jovem na ilha de Samos, a educação inicial de Pitágoras incluiu em grande parte aprender a tocar lira e recitar poesia de autores como Homero. Ele também teria sido educado por caldeus e sírios sábios durante viagens com seu pai a Tiro.
Seus principais professores, quando jovem, são considerados os filósofos Pherekydes, Thales e Anaximander, os dois últimos sendo um professor e aluno que viveu em Mileto.
Por volta de 535 a.C., Pitágoras estudou no Egito no templo de Dióspolis, ou a antiga Tebas, hoje Luxor dos dias modernos.