As temperaturas mais altas em Júpiter são encontradas em seu núcleo e são estimadas em mais de 60.000 graus Fahrenheit. Devido à distância de Júpiter do Sol, a maior parte de seu calor vem de seu núcleo e a temperatura em geral diminui afastando-se do centro do planeta.
Júpiter atinge temperaturas estimadas de mais de 17.000 graus Fahrenheit perto do núcleo quando o hidrogênio do gigante gasoso se liquefaz. No ponto em que a pressão em Júpiter é 10 vezes a pressão média na Terra, a temperatura de Júpiter é aproximadamente equivalente à temperatura ambiente na Terra. No nível externo de suas nuvens, a temperatura de Júpiter cai para cerca de 229 graus Fahrenheit negativos.