O mod "Minecraft" Pixelmon combina a construção e os elementos criativos de "Minecraft" com a aventura e a coleta de elementos de "Pokémon". Um usuário pode capturar Pokémon, treinadores de batalha ou explorar o mundo Pixelmon usando o mod.
O primeiro passo para usar o mod pack Pixelmon é instalá-lo através do Technic Launcher ou Forge. Com cada novo jogo, uma caixa de diálogo aparece e solicita que o jogador selecione seu Pokémon inicial. Pokébolas e outros equipamentos são criados com materiais comuns do "Minecraft", como lingotes de ferro e botões de pedra.
Ao lutar ou capturar um Pokémon selvagem, acertá-lo com uma Pokébola lançada abre um menu de batalha criado no estilo dos jogos "Pokémon" originais. Os jogadores de Pixelmon podem pesquisar o mundo para coletar um de cada Pokémon, batalhar e derrotar os outros treinadores ou construir suas próprias estruturas personalizadas. Mapas e mundos adicionais do Pixelmon também estão disponíveis para exploração.
Se estiver procurando por opções de jogo e expansões extras, os jogadores podem entrar em um servidor "Minecraft" dedicado ao Pixelmon. Esses servidores permitem que vários jogadores se unam e construam, lutem ou negociem. Alguns servidores personalizam a experiência Pixelmon com mods adicionais que removem danos de queda e fome, enquanto outros adicionam objetivos e competições em grupo. Os servidores também oferecem bate-papo aberto com outros jogadores e opções de troca para trocar Pokémon.