Os metabólitos secundários produzidos pelas plantas são substâncias químicas que não têm função definida no metabolismo da planta, incluindo crescimento, fotossíntese, reprodução e outras funções primárias. Muitos metabólitos secundários produzidos por plantas desempenham papéis importantes na vida humana.
Um tipo de metabólito secundário produzido por plantas, os flavonóides, são apresentados como tendo propriedades antioxidantes e são consumidos por humanos por esses benefícios, bem como propriedades antiinflamatórias. Os flavonóides também podem ser conhecidos como vitamina P ou citrina. Os fitoestrogênios, um metabólito secundário encontrado em nozes, sementes e outros alimentos, são substâncias químicas que imitam o hormônio estrogênio. Eles são pensados para proteger a saúde óssea e do coração.