A organela que contém a maioria das enzimas hidrolíticas em uma célula é o lisossoma. Os lisossomas são organelas relativamente pequenas, delimitadas por membrana, que as células usam para vários fins, incluindo quebrar moléculas orgânicas, lutar organismos que causam doenças e reparam suas membranas celulares.
Os lisossomos são vitais para a digestão dentro da célula e usam suas enzimas para quebrar os alimentos em formas que a célula pode usar. Se não houver comida suficiente no ambiente, os lisossomos também são capazes de quebrar outras organelas para os materiais necessários. Quando usados para defesa, os lisossomos podem destruir patógenos que atacam uma célula ou, em animais, podem ser implantados por células imunológicas especializadas para destruir patógenos que colocam diferentes células em perigo. Essas células engolfam os patógenos e liberam as enzimas hidrolíticas dentro dos lisossomos sobre elas.
As enzimas nos lisossomos são perigosas para a célula que as cria. Se a membrana de um lisossoma vazasse, ele poderia digerir a própria célula. Essa membrana é composta de lipídios, enquanto as enzimas que contém são proteínas. Os lisossomos são geralmente encontrados apenas em células animais ou semelhantes a animais. As células vegetais geralmente não têm lisossomos, pois suas paredes celulares as protegem dos perigos que os lisossomos normalmente lutam.
