Fatores bióticos são organismos vivos que afetam um determinado ecossistema e seus relacionamentos. Peixes, sapos, plantas aquáticas, bactérias e insetos são fatores bióticos no habitat de um rio.
Medições indiretas de fatores bióticos estabelecem informações valiosas sobre um ambiente e seus habitantes. Uma alta concentração de clorofila a em um estuário é um indicador de proliferação de algas; um aumento perigoso no número de algas que pode levar à morte dos habitantes do estuário. Uma queda na biodiversidade sinaliza a diminuição da saúde de um ecossistema.
Fatores abióticos são impactos não vivos em um ecossistema e incluem clima, formas de relevo, salinidade da água e eventos geológicos. As medições da densidade do solo, disponibilidade de água e horas de luz solar indicam a probabilidade de sobrevivência das plantas e de animais dependentes dessa planta como fonte de alimento. Padrões de clima mais secos mudam a composição de um habitat para espécies favoráveis à seca.
Os estudos de fatores bióticos e abióticos têm impactos comerciais. O cupim subterrâneo de Formosa causa danos de até US $ 2 bilhões por ano nos Estados Unidos. Identificar o valor de um determinado relevo para os cupins permite medidas de prevenção focalizadas em sua localização. A contaminação por metilmercúrio de uma usina de carvão se acumula nos tecidos dos peixes e não só causa danos à indústria da pesca esportiva, mas exige novos protocolos para avisos de consumo de alimentos inseguros.