A recombinação somática se refere ao processo que envolve a formação de genes de imunoglobina por meio da recombinação dos elementos genéticos da linha germinativa, ou segmentos do gene da imunoglobina, em um único locus. Esse processo ocorre no tecido linfoide primário, que é a medula óssea para as células B e o Timo para as células T. A recombinação somática precede o contato com o antígeno e ocorre durante o desenvolvimento das células B na medula óssea.
Em mamíferos, os segmentos do gene da imunoglobina são organizados em grupos de exões variáveis (V), diversidade (D), junção (J) e constantes (C). Em linfócitos de vertebrados, a recombinação somática combina segmentos gênicos variáveis, diversos e de união quase aleatoriamente. Escolhas aleatórias de genes diferentes resultam em codificações diversas de proteínas, antígenos correspondentes de bactérias, parasitas, vírus, células disfuncionais e pólens.
Um DH e um JH são combinados aleatoriamente com a remoção de todo o DNA intermediário (junção D-J). Isso é seguido por emenda aleatória do segmento VH para o segmento DJH reorganizado. As sequências intervenientes entre VDJH e CH são transcritas em mRNA primário. No núcleo, o splicing do mRNA primário produz mensagem madura, que é traduzida na cadeia H quando transportada no citoplasma. O DNA humano para a cadeia H tem cerca de 50 segmentos VH funcionais, 30 segmentos DH e seis segmentos JH. Os primeiros dois CDR e três FR da região variável da cadeia pesada são codificados por VH.
A formação aleatória de muitas combinações diversas de VJL e VDJH geram diversidade combinatória. Por outro lado, a união imprecisa de segmentos gênicos e a adição de nucleotídeos aos locais de splice da sequência de DNA resultam na diversidade juncional.
