A geometria molecular do IF5, também conhecido como pentafluoreto de iodo, é uma pirâmide com uma base quadrada em torno de um átomo de iodo central. Cada um dos cantos da pirâmide é um átomo de flúor.
O ângulo entre cada uma das ligações na molécula é de 90 graus para os quatro átomos de flúor que constituem a base da pirâmide e de 180 graus para o único átomo de flúor que compõe o ponto da pirâmide. A estrutura bidimensional do pentafluoreto de iodo é escrita como um átomo de iodo central rodeado por cinco átomos de flúor em uma forma de estrela semelhante a um asterisco, mas isso é por conveniência e não corresponde à verdadeira forma da molécula ou aos ângulos de ligação envolvidos .
O pentafluoreto de bromo tem uma forma muito semelhante ao pentafluoreto de iodo.